Chương trình Nghiên cứu của APUS dành cho những sinh viên có định hướng và muốn theo đuổi nghiên cứu khoa học. Học sinh sẽ được đào tạo về phương pháp nghiên cứu và nhận hướng dẫn từ chuyên gia để hoàn thành các dự án nghiên cứu của mình và tham gia các hội chợ khoa học. Trong chương trình, sinh viên được làm việc 1-1 với một nhà nghiên cứu đến từ các trường đại học tầm cỡ thế giới để tạo ra một dự án nghiên cứu độc lập.